本處置處長1人，由農業部農田水利署指派，綜理處務，其下設置副處長1人、4組2室：管理組、資訊室、財務組、總務組、主計室及人力資源室，分別掌理有關業務。

　　事業區內設有17個水利小組，北投區：北投、嗄嘮別、一德、八仙一、八仙二、唭哩岸一、唭哩岸二、石牌、洲美、十八份；士林區：平等、士林、湳雅；內湖區：東湖；南港區：東新庄子；汐止區：北峰、北山。

　　本處推動業務不拘泥於灌溉排水，而係將視野放大放遠，以符合時代發展趨勢、符合國家社會利益作為本處努力之目標。因此各項工作需各組室全力支持配合，才能達標 。

　　在原有灌溉用水管理、灌溉渠道維護管理等業務之外，積極了解農友需求，發掘問題，成為開拓新業務的第一線、也是多項創新業務的執行者，近年來、完成許多亮眼成果，包括圳路改善、推廣旱灌、綠肥花海、友善環境農法等等。

　　本處土地依據面積大小有不同處理方式。

• 土地面積較大者：1.自建大樓後出租；2.BOT模式；3.空地招租。
• 土地面積較小、畸零地參與都更、取得房屋增加租金收益、或標售、讓售、增加資金收入。

　　業務範圍十分多面向，包括資訊計畫擬定及資通安全推動、資訊軟體管理及維護、資訊硬體管理、機房管理及維護、資料管理、網路管理、資訊應用之教育訓練及諮詢服務。

　　為處務推動最強大的後勤支援體系，包括文書管理、法令規章，環境維護、車輛調度、用品管理等等，以及出納業務相關事項，包羅萬象，在在關係全處之運作。

　　預、決算編列及執行情形之掌握，經費開支之內部審核，各項採購案件及財產處分之監辦事項，為本處年度收入支出管理者，確保本處收入支出之平衡，永續經營。

　　處長常說，「人」是本處最大資產，無論任免遷調、考核獎懲、訓練進修、差勤管理等之執行必須合法合理也合乎情，維持人事穩定，強化同仁之凝聚力。

依據灌溉管理組織辦理事項之範圍如下：

1. 農田水利用水調配及管理。
2. 灌溉用水秩序維護及水利小組業務輔導。
3. 農田水利設施興建、管理、改善及維護。
4. 農田水利設施災害預防及搶救。
5. 灌溉管理組織內專任職員之人事管理。
6. 農田水利事業作業基金所屬資產管理及收益。
7. 主管機關及農業部農田水利署交辦事項。